# 分析材料对RNA转录组的影响 ## 一、转录组数据分析 - 差异基因分析 - 用什么方法？ - https://zhuanlan.zhihu.com/p/281809822 - 使用富集分析结果中显示出的与研究内容相关的通路关联的所有差异基因 - 在测序数据中使用多元线性/多项式回归分析差异基因，高、中、低、无四种标签分别设为(9,5,1,0)/(8,4,2,1)两种定量因变量值 - PCA主成分分析（备选） ## 二、材料数据分析 - XPS - <https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUxMDMzODg2Ng==&mid=2247523225&idx=1&sn=8d8302b1d1faaaa98fa9dbb37c687406&source=41#wechat_redirect> - <https://mp.weixin.qq.com/s？__biz=MzUxMDMzODg2Ng==&mid=2247523195&idx=1&sn=f0712664fffb38ad789feaf3335509b9&source=41#wechat_redirect> ## 三、综合分析 ### 连续数据 - 多元线性回归 - https://wiki.mbalib.com/wiki/%E5%A4%9A%E5%85%83%E7%BA%BF%E6%80%A7%E5%9B%9E%E5%BD%92%E5%88%86%E6%9E%90%E9%A2%84%E6%B5%8B%E6%B3%95 - t检验：https://zhuanlan.zhihu.com/p/138711532 - logistic？序数回归 - https://en.wikipedia.org/wiki/Ordinal_regression - https://www.ibm.com/docs/zh/spss-statistics/25.0.0?topic=regression-ordinal-options - https://blog.csdn.net/chaipp0607/article/details/90739483 - 多项式回归 - 验证线性相关性（协方差） - https://zhuanlan.zhihu.com/p/77555547 ### 离散化数据 - 决策树/随机森林 - 关联分析 - https://www.cnblogs.com/beaver-sea/p/4740561.html - https://www.cnblogs.com/LittleHann/p/9398219.html